Les équipes de recherche accueillant des étudiants en doctorat dépendent de deux écoles doctorales au sein d'AMU.
Elle rassemble un ensemble d'unités et d'équipes de recherche de Marseille qui ont une activité scientifique reconnue dans les domaines variés : chimie organique, chimie physique, chimie des matériaux et chimie théorique.
Ecole Doctorale : ED 250 Sciences Chimiques
Ecole Doctorale : ED 352 Physique et Sciences de la Matière